Urenhedskontrol i L-methylfolat-ingrediensen er vigtig, da urenheder kan mindske den biologiske aktivitet, øge toksiciteten og påvirke den kliniske effekt af L-methylfolat. JK12A er en oxidativ urenhed af L-methylfolat. De seneste resultater viste, at JK12A negativt påvirkede væksten af zebrafiskembryoner og ændrede både hjertefrekvensen og overlevelseshastigheden på en dosisafhængig måde.
Magnafolat er i øjeblikket det mest stringente urenhedskontrol råmateriale i L-methylfolat, kendt som det reneste L-methylfolat på planeten.